Пещера располагается на высоте 2100-2400 м над уровнем моря в 25-ти км к западу от центра Манхан Сомона Ховд аймака. Она образована из карбонатных пород т.е. из бело-серого известкового мрамора.
Высота внутренней стены – 15 м, от пола до свода достигает 20 м, форма свода вогнутая изнутри наружу, то есть имеет куполообразную вершину. Почерневшие от огня стены доказывают, что люди жили в пещере на долгий период времени. Также на стене располагаются петроглифы – исторические памятники, насчитывающие более 40 тысяч лет.
На стенах и сводах пещеры изображены различные животные, среди которых страусы, индейки, журавли, верблюды, мамонты, буйвол с большими рогами, изюбр с ветвистыми рогами, змеи, елововидные деревья.
Также есть несколько наскальных рисунков более позднего периода. Они изображены густыми красными и светлыми красками, некоторые изображения животных перекрывают друг друга, контур других очерчен пятнистыми точками. Среди изображений, наложенных друг на друга животных, внимание привлекает четко обозначенный пол самца оленя.
Изображения вымерших животных, населявших Монголию в древние временана, свидетельствуют о том, что эти наскальные рисунки относятся к периоду позднего каменного века. Из них особое внимание привлекает изображение мамонта. Это дало возможность выдвинуть предположение о существовании мамонтов в Монголии, что в последствии было окончательно подтверждено в 1998 году совместным исследованием Национального университета Монголии и филиала университета в Ховд аймаке, которые нашли в месте под названием Тэсэрхий около источника Буулт на территории Дургун сомона останки мамонта, сохранившиеся на 70%. Рисунки выбиты кремниевыми резцами, а затем раскрашены красной и земляной краской.
Петроглифы пещеры считаются ценными находками ввиду того, что в Монголии редко встречаются памятники каменного века. Также судя по животным, обитавшим в те времена, можно сделать вывод что Монголия имела теплый климат. После изучения пещеры исследователи пришли к выводу, что “искусство Азии берет свое начало в Центральной Азии, а именно на территории Монголии.” Иногда даже называют пещеру “Центральноазиатским очагом певобытного искусства”. Пещера берет свое название “Хойд цэнхэрийн агуй” от реки Цэнхэр Ховд аймака, так как находится на берегу этой самой реки.
Эта пещера была впервые обнаружена географом О.Намнандорж, а потом уже тщательно изучена Монголо-советскими учеными-археологами Н.Сэр-Оджав, Д.Цэвээндорж, Д.Дорж, А.П.Окладниковым, В.В.Ларичевым, А.П.Деревянко. В Монголии зарегистрировано пять наскальных рисунков, относящихся к периоду позднего каменного века, три из которых находятся на территории Ховд аймака. Одним из них является исторический памятник пещеры “Хойд цэнхэрийн агуй”.
У пещеры также есть и другое название – Гурван цэнхэрийн агуй (букв. Пещера трех синих). Данное название произошло от того что на территории Манхан сомона текут и входят в единое русло три реки урд Цэнхэр (южная Синяя) дунд Цэнхэр (средняя Синяя), хойд Цэнхэр (cеверная Синяя), которые берут свое начало С Алтайского хребта.